造成數控系統故障而又不易被發現的一個重要原因是干擾。隨著電子元件的表面貼裝化和大規模集成電路的發展，CNC體積已越來越小，CNC單元在電氣柜中多被安裝在距離產生噪聲元件較近的地方，所以應該注意干擾對CNC穩定性的影響。干擾是影響數控機床正常進行的一個重要因素。
消除系統的干擾可以從下述幾個方面著手：
1、正確連接機床、系統的底線。
2、防止強電干擾。
3、抑制或減小供電線路上的干擾。
4、信號線的分組處理。
5、數控機床各接地線的連接。
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